В новой версии itunes исчезла вкладка книги и теперь чтобы загрузить книгу на ipad и iphone  в стандартное приложение ibooks потребуется :
1. Открыть ibooks;
2. Щелкнуть по разделу PDF или по любому другому, который вам больше нравится;
3. В меню ibooks выбрать в меню Файл – добавить в библиотеку и выбрать книгу в формате ebook или pdf-файл и нажать открыть.

4. Теперь книга добавлена в ibooks. Заходит в itunes, выбираем наше устройство, идем на вкладку книги и наблюдаем добавленный только что в ibooks файл.

Вселенная Apple всегда стремилась к тому, чтобы пользователю можно было выполнить любое действие за минимальное число шагов, но Itunes это нечто, мне кажется, что ее разрабатывали разработчики из другим компаний во вред Apple, потому как все это шаманство с файлами иначе как неразберихой не назовешь.

Надеюсь, статья помогла загрузить pdf на iOS. Приятного чтения!